Cohort data
NIBN JMDデータの詳細
NIBN JMDには、NIBNで収集した腸内細菌叢データと食事、摂取栄養素や身体活動などの生活習慣に関するデータ (表現型メタデータ) を収載しています。今後、症例対照研究や介入研究のデータについても収載していく予定です。腸内細菌叢のデータとしては、16S rRNA遺伝子アンプリコンシーケンシングとショットガンメタゲノムシーケンシングのデータがあり、それぞれ4,578件と4,302件のデータを収載しています。このうち一部のデータについてはNIBN JMD (公開用) として一般公開しています。詳細は以下の論文を参照してください。Chen YAら (2025) Scientific Reports 15(1):19640.
サンプル採取地別のデータの数
| サンプル採取地 | NIBN JMD | NIBN JMD (公開用) | |
|---|---|---|---|
| 16S rRNA gene | Shotgun | 16S rRNA gene | |
| 新潟県南魚沼市 | 625 | 625 | 625 |
| 東京都新宿区 | 481 | 475 | 481 |
| 東京都港区 | 26 | 0 | 13 |
| 神奈川県横浜市 | 68 | 0 | 0 |
| 神奈川県厚木市 | 143 | 50 | 98 |
| 山梨県中央市 | 672 | 671 | 258 |
| 京都府京都市 | 42 | 0 | 0 |
| 大阪府大阪市 | 984 | 946 | 277 |
| 大阪府吹田市 | 184 | 184 | 37 |
| 兵庫県加東市 | 328 | 328 | 0 |
| 山口県周南市 | 940 | 938 | 399 |
| 山口県長門市 | 85 | 85 | 85 |
| 総計 | 4,578 | 4,302 | 2,273 |
※一部、縦断研究のデータ含む
Phenotype metadata
表現型メタデータ
NIBN JMDには、食事、摂取栄養素、運動習慣等の様々な表現型メタデータが収載されており、詳細は以下のリンクから確認できます。これらのデータのうち、一部のデータについてはNIBN JMD (公開用)で公開しています。その他のデータについては、研究倫理審査の承認を受けた共同研究機関にのみ提供します。
NIBN JMD（公開用）
NIBN JMD（公開用）には、九つの各地域（新潟県南魚沼市、東京都新宿区・港区、神奈川県厚木市、山梨県中央市、大阪府大阪市・吹田市、山口県周南市・長門市）から2,068名（女性：1,159名、男性：909名）計2,273サンプルの腸内細菌叢データに加え、地域、年齢、性別、食事と摂取栄養素のデータが収載されています。これらのデータは、独自に開発した統合解析プラットフォームMANTAを用いて公開しています。
【重要】NIBN JMDデータの利用方法変更のお知らせ
2026年2月5日より、データベースの継続的な更新およびサービス向上のため、NIBN JMDデータのご利用にはユーザーアカウントの作成が必須となりました。以前からご利用の皆様にはお手数をおかけいたしますが、利用申請書の提出をお願いいたいます。（利用申請書フォーム ⇒ [ダウンロード] ）
